在2021年3月9日 14:25,openEuler conferencepublic@openeuler.io 写道:
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openEuler sig-bio SIG 邀请您参加 2021-03-11 10:00 召开的ZOOM会议(自动录制)
会议主题:BIO-SIG 第一次例会
会议内容:Sig 组成立,2021年工作规划和进展同步,SIG组运作模式讨论
会议链接:https://zoom.us/j/94506876048?pwd=elZ4ZlphdkNhYjUwVTVXZE9uQjY2QT09
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继续申报议题: 1、BIO SIG组2021年工作规划讨论,以及后续运作模式讨论(例会周期、组织形式、会议纪要、轮流主持等) 2、生信软件仓诉求搜集,以及生物信息案例征集
在2021年3月9日 19:27,何仁贵herengui@uniontech.com 写道:
Hi 中元,
我们第一次sig例会,我申报一个议题:
议题申报:
1)统信软件适配生信领域软件的背景和进展。
谢谢,
何仁贵 17629004922
From: "zhouzhongyuan96 zhouzhongyuan96@163.com"
To: "public@openeuler.io public@openeuler.io"
CC: "tc@openeuler.org tc@openeuler.org"
Sent: 2021-03-09 15:39
Subject: [Tc] BIO SIG例会议题征集 回复:BIO-SIG 第一次例会【请注意,邮件由tc-bounces@openeuler.org代发】
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申报议题: 麒麟软件搜集的生信软件的需求汇报
在 2021-03-10 09:17:47,"zhouzhongyuan96" zhouzhongyuan96@163.com 写道:
继续申报议题: 1、BIO SIG组2021年工作规划讨论,以及后续运作模式讨论(例会周期、组织形式、会议纪要、轮流主持等) 2、生信软件仓诉求搜集,以及生物信息案例征集
在2021年3月9日 19:27,何仁贵herengui@uniontech.com 写道:
Hi 中元,
我们第一次sig例会,我申报一个议题:
议题申报:
1)统信软件适配生信领域软件的背景和进展。
谢谢,
何仁贵 17629004922
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在2021年3月9日 14:25,openEuler conferencepublic@openeuler.io 写道:
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轮值主持人: 周中元 @zhouzhongyuan1@163.com 下一次主持人: 杨昭 @yangzhao1@kylinos.cn
与会人: 侯健、叶青龙、杨昭、何仁贵、陈鑫鑫、魏东、潘晨博、侯越、张少杰、荣誉、罗檬、陈衎、周中元等等
会议纪要: https://etherpad.openeuler.org/p/sig-bio-meetings
会议议题讨论记录 1)2021年工作规划以及后续运作模式讨论 2021年工作规划主要有三部分:openeuler上生信软件仓的建设,生信应用场景在openeuler的移植,外部参会运维 张少杰博士:提出在生物信息群体分析领域,搭建生信自动化数据分析流程的诉求,可以降低生信初学者的学习门槛,加快生信研究者的分析效率。 罗檬博士:生信自动化数据分析流程是生信领域一个很好的方向
SIG组的后续运作模式主要包括两周一次的例会、轮值主持、会议纪要记录、邮件列表和社区讨论。 麒麟侯健:补充了组织线下交流活动,加强企业跟高校生物信息研究的线下沟通
2)统信软件适配生信领域软件的背景与进展 统信叶青龙:通信已经移植了很多生物信息领域的软件,并打包成rpm包的形式,主要目的是扩展操作系统生态,未来可以参与生信软件仓的建设。 华为陈衎:提出了对生信软件进行分类和版本推荐的想法,在满足软件能用的基础上,提供性能更好的软件。
3)麒麟软件搜集的生信软件的需求汇报 麒麟侯健列举了在生物信息领域适配软件问题: 1. 缺乏多架构的适配。只有X86的安装包,缺乏arm平台软件包的支持。且在arm平台源码编译构建生信软件包,出现了缺少架构相关的关键库的安装问题。 讨论结论:建议在华为内部寻求鲲鹏(AMR)技术人员的支持 3. 迭代速度比较快,产品迭代周期怎么考虑,版本自动化怎么考虑 讨论结论:参考package SIG组stream流式包管理方法,管理同款软件的多版本问题 4. docker镜像与制作对应的rpm包问题讨论 讨论结论:rpm包需要制作的基础二进制包,可以继续推动生信软件仓在云原生docker镜像这块的发展。
4)生信软件仓建设的诉求和进展 周中元:目前整合了统信已有的软件清单,已经梳理出3月计划入库的生信软件清单,下一步就是具体的落实。
5)生信场景移植openEuler案例征集和进展 周中元:目前已经跟昆明动物研究确定了犬类群体野性化研究移植到openeuler系统上,征求更多的生物信息应用场景。
6)麒麟软件关于在openeuler上孵化生信平台\工具的一些想法 麒麟杨昭:提出了跟高校生信实验室合作在openeuler上孵化出模块化的数据分析平台的想法,可以共享一些开发框架和相关技术,避免重复工作,加快开发速度。 讨论结论:下次例会或者线下活动,跟高校生信实验室详细讨论业务诉求和开发计划。
麒麟软件在图像渲染方面有丰富的经验,很乐意跟高校生信实验室合作,去开发一些有价值的生信画图工具。 讨论结论:下次例会或者线下活动,跟高校生信实验室详细讨论业务诉求和开发计划。
遗留问题: 1、针对生信软件在arm平台支持不好的问题,如何解决,如何获取鲲鹏技术人员的支持? 2、生信软件多版本管理问题的解决方案 3、如何在麒麟和高校生信实验室之间展开生信画图工具的合作开发计划? 4、如何在openeuler上孵化出模块化的数据分析平台?
在2021年3月10日 19:09,侯健hj19870806@163.com 写道: 申报议题: 麒麟软件搜集的生信软件的需求汇报
在 2021-03-10 09:17:47,"zhouzhongyuan96" zhouzhongyuan96@163.com 写道:
继续申报议题: 1、BIO SIG组2021年工作规划讨论,以及后续运作模式讨论(例会周期、组织形式、会议纪要、轮流主持等) 2、生信软件仓诉求搜集,以及生物信息案例征集
在2021年3月9日 19:27,何仁贵herengui@uniontech.com 写道:
Hi 中元,
我们第一次sig例会,我申报一个议题:
议题申报:
1)统信软件适配生信领域软件的背景和进展。
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何仁贵 17629004922
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